Operation: Matriarchy

В 24 веке человечество сформировало Федерацию Земли и колонизировало несколько других планет. Однако около 2350 года загадочный вирус опустошает планету-колонию Велия, поражая только женщин среди населения. Их превращают в жестокие машины для убийства, а самцов порабощают для использования в качестве пропитания или в качестве объектов для генетических экспериментов. Теперь, превратившись в агрессивный коллективный разум, велианцы обращаются против Федерации, разжигая жестокую войну.

Игра начинается через семь лет после начала конфликта, когда персонаж игрока, старший сержант Пол Армстронг из Федерации , оказывается вынужденным сразиться с велианцами, когда они атакуют его корабль.